Uitgeverij Troje is in 1982 opgericht als muziekuitgeverij. Het doel was om muzikanten, componisten en tekstschrijvers te helpen hun werk uit te brengen zonder gedwongen te worden om wurgcontracten te tekenen bij de uitgeverijen van grote platenmaatschappijen. Die contracten eisten het overdragen van (een deel van) de auteursrechten, waarmee niet alleen 33 tot 50% van de mogelijke opbrengsten naar de uitgever - dwz. de platenmaatschappij - gingen, maar ook de artistieke rechten bij de uitgever belandden. Dat betekende dat de platenmaatschappijen met het werk mochten doen wat ze maar wilden: tekst en muziek veranderen, het gebruiken voor allerlei doeleinden, enzovoort. Vooral om dat tegen te gaan bood Troje contracten aan waarin de rechten volledig bij de maker bleven.

Tot de doelstelling van Troje behoorde vanaf de oprichting ook: "Het bevorderen van een vrijer leefklimaat, het stimuleren van creatieve beweging en het verspreiden van het vrije woord en vrije muziek." Vanuit die doelstelling heeft Troje het uitbrengen van muziek in eigen beheer zeer actief gesteund en veel platen, cd's en projecten mogelijk gemaakt

Nu muziekkunstenaars dankzij voortschrijdende techniek en talloze nieuwe media in veel gevallen zonder problemen hun werk zelf kunnen uitbrengen, richt Troje zich meer op wat momenteel een bedreigde kunstvorm lijkt te worden: woorden op papier. Het verdwijnen van steeds meer kleine - met name linkse - boekhandels en kleine uitgeverijen en het monopolie op distributie van het Centraal Boekhuis - dat een flink deel van de opbrengst opeist en daarmee boeken extra duur maakt - zorgt er voor dat het voor onafhankelijke en tegendraadse auteurs behoorlijk lastig is om hun woorden nog in boekvorm uit te brengen. Troje probeert hen daarbij te steunen en te helpen, voorlopig vooral op het terrein van de toch al zo verwaarloosde poëzie.
Verder verzorgt Troje de distributie van boeken van sommige andere kleine uitgeverijen.

Troje heeft geen winstoogmerk.